全球首台正式版Nanopore PromethION 48 入驻百迈客
好消息!好消息!继今年9月底百迈客再次引进PacBio公司的sequelⅡ三代测序平台后,昨天全球首台正式版Nanopore PromethION 48 也到达百迈客,为三代家族再添新!截止现在,百迈客已拥Nanopore 平台:PromethION-48、PromethION-β、Nanopore GridION、Nanopore MinION;PacBio平台 :RS Ⅱ、PacBio Sequel、PacBio sequel Ⅱ。可以说百迈客拥有市场上主流的三代测序平台,为客户提供最全面优质的选择!
升级介绍
之前已经给大家介绍过PacBio公司从Sequel升级到SequelⅡ后,我公司通过实测总数据量产出显示提升了约8倍!那么这次英国牛津纳米孔公司从PromethION-β升级到PromethION 48(以下简称P48) 有什么变化呢?相比原来的PromethION–β,P48流动槽的个数由原来的24个(β型标准芯片数)提升到48个,体积更是缩小了一半,内存384Gb不变,存储由28Tb增加到64Tb,仍然可直接用于数据处理,在测序过程中即可实现实时的鉴定和比对分析。高通量的P48通过同时运行48张测序芯片,官方已获得7.3Tb的数据量,理论上最大数据量为15Tb。而且P48测序仪仍有进一步改进的空间,将来可能生成20Tb的数据。图二:安装好后的仪器,P48通量提升外观简洁依旧。
图三:我们的科研人员准备上机测试中。
图四:我们的三代上机研发团队。60%以上拥有硕士学历及5-10年的测序行业的经验。
Nanopore 测序原理
Nanopore测序是将人工合成的一种多聚合物的膜浸在离子溶液中,多聚合物膜上布满了经改造的穿膜孔的跨膜通道蛋白(纳米孔),也就是Reader蛋白,在膜两侧施加不同的电压产生电压差,DNA链在马达蛋白的牵引下,解螺旋通过纳米孔蛋白,不同的碱基会形成特征性离子电流变化信号,通过对这些信号的检测,得到碱基序列,完成测序。
Nanopore 测序特点
测序读长超长,平均读长约25Kb,Reads N50约40Kb,最长reads可以达到Mb水平;
碱基错误率约15%,与PacBio错误率基本相同;
可以直接读取碱基修饰信息(4mC、5mC、6mA);
无需PCR,没有GC偏好性。
百迈客Nanopore技术优势
专业性强:中国大陆首家通过 PromethION/GridION 双平台 DNA/RNA 样本的公司,拥有多年Nanopore研发基础。
项目经验丰富:超过了百种物种类型的文库构建,从常规到特殊物种均能完美应对。
今年1月份Nanopore公司官方宣布:当前用户中,PromethION单Cell最高产出记录由百迈客产生!文库质量及数据产量均有保障!
精英团队:百迈客团队聚精英人才具有丰富的项目经验,从常规到个性化人员配置齐全!
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